Holotype

Type (biologie)

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En sciences de la vie, un type est un élément de référence attaché à un nom scientifique^[1] (et non pas à un taxon), à partir duquel une espèce vivante (ou ayant vécu), a été décrite. Il désigne le matériel original ayant servi à la typification.

Avec le temps, les conditions et indications à réunir pour qu'un élément soit admis comme type sont devenues plus nombreuses et strictes.

Les différents « types »

Un type peut être :

• un spécimen^[2] conservé par un moyen quelconque (herbier, champignons séchés ou lyophyllisés, animal naturalisé) ;
• une culture (bactériologie, mycobactériologie, virologie) ;
• une illustration (iconotype), si elle respecte les conditions fixées par le Code de nomenclature compétent.

Cette terminologie s'applique essentiellement aux noms spécifiques et infraspécifiques, mais peut être implicitement étendue aux noms de taxons supérieurs à l'espèce.

Cela serait souhaitable mais le type n'est pas nécessairement l'élément le plus « typique » du taxon correspondant.

La désignation d'un type est obligatoire pour tout nom de nouveau taxon publié à partir d'une certaine date (variable selon les disciplines ; 1958 pour la mycologie, par exemple).

Il y a trois principales catégories de types. L'holotype, le plus important, et deux autres catégories qui concerne la typification postérieure des noms anciens (publiés avant une date fixée par les Codes, par exemple avant 1958 pour la mycologie) dépourvus de type à l'origine. Cette typification permet de résoudre des problèmes de priorité et de fixer l'interprétation de taxons jusque là contestés.

Épitype

L'épitype est un spécimen (ou illustration) choisi comme modèle d'interprétation quand l'holotype, le lectotype ou le néotype antérieurement désigné, ou quand l'ensemble du matériel original, associé à un nom validement publié, est manifestement ambigu (c'est-à-dire de façon démontrable) et ne peut être identifié de manière probante pour de donner une application précise à un nom de taxon.

Lorsqu'un épitype est désigné, le type auquel il fait référence (holotype, lectotype ou néotype) doit être explicitement cité.

Holotype

L'holotype est le type original, explicitement désigné par l'auteur du nom dans la publication originale (publication validante). L'holotype est toujours celui d'un nom de taxon (et non d'un taxon) ; l'holotype d'un taxon est un concept qui n'a pas de sens.

Les différents codes de nomenclature s'accordent sur l'unicité du spécimen type, avec quelques aménagements parfois, dans le cas par exemple des spécimens de palmiers dont les parties du même individu peuvent être montées sur plusieurs feuilles, toutes considérées comme autant de parties de l'holotype.

Isotype

On nomme isotype le double de l'holotype quand il existe (un fragment de celui-ci, ou une partie de la récolte constituant le spécimen type). Les isotypes sont parfois mentionnés dans le protologue. D'une façon plus générale, cette notion se décline avec toutes les catégories de types, on parlera d'isolectotype, isosyntype, isonéotype, isoépitype, etc.

Lectotype

Le lectotype est le spécimen qui devient le type nomenclatural en absence d'holotype lors de la publication d'origine. Il est possible de lectotyper un taxon postérieurement et officiellement (une validation latine n'est pas nécessaire) en choisissant un lectotype parmi les éléments du matériel original s'il en subsiste. Il peut s'agir de tout spécimen (ou illustration) sur lesquels on peut démontrer que la description originale a été basée.
S'il est unique, ce matériel devient automatiquement un type (virtuel) appelé « lectotype obligatoire non désigné ».
Pour être reconnu, il doit être publié suivant des règles consignées dans le Code.

Néotype

Le néotype est le type désigné en l'absence de tout matériel original (sauf pour les noms sanctionnés). C'est un spécimen ou une illustration qui tient provisoirement lieu de type nomenclatural (tant que tous les matériaux sur lesquels a été fondé le nom du taxon font défaut). Il peut être contesté sous certaines conditions.

Paratype

Le paratype est un spécimen cité dans le protologue qui n'est ni l'holotype, ni un isotype, ni l'un des syntypes quand l'auteur a désigné plusieurs spécimens à la fois comme types.

Syntype

Le syntype est un ou plusieurs spécimens cités dans le protologue quand l'auteur qui n'a pas désigné d'holotype ou qu'il en a désigné plusieurs à la fois comme types.

Historique

La nécessité de typification des noms de taxons a mis du temps à se dégager. L'un des premiers zoologistes à utiliser le concept de type (même s'il n'utilise pas le mot) est Mathurin Jacques Brisson (1723-1806).

Notes et références

1. ↑ On dira le « type d'un nom (de taxon) » et non le « type d'un taxon ».
2. ↑ Au sens nomenclatural, un spécimen n'est pas nécessairement constitué par un seul échantillon. L’Art. 8.2 du Code « Saint Louis », la définition d’un spécimen type a été révisée, afin de rendre clair que plusieurs plantes ou parties de plantes appartenant à une seule et même récolte ou taxon, lorsqu’elles sont montées ensemble sur une seule planche d’herbier ou une préparation équivalente, forment un unique spécimen. Ce peut donc être plusieurs carpophores d'une même récolte de champignons (en théorie, d'un même mycélium)

• G. Redeuilh, Vocabulaire nomenclatural, Bull. Soc. Mycol. France 118(4) : 299-326
• Aline Raynal-Roques, 1994 ; La botanique redécouverte, éditions Belin (voir pages 47 à 60 sur « la nomenclature botanique »).

Voir aussi

Articles connexes

• Nomenclature botanique
• Type nomenclatural (botanique)
• Type nomenclatural (zoologique)

Liens externes

• Liste des termes liés au type, de Ronald H. Petersen
• Index Synonymique de La Flore de France (ISFF, de Michel Kerguelen)

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