Phytophthora

Phytophthora
Aide à la lecture d'une taxobox Phytophthora
 Phytophthora porri sur une feuille de poireau (Allium porrum)
Phytophthora porri sur une feuille
de poireau (Allium porrum)
Classification
Domaine Eukaryota
Règne Chromalveolata
Division Stramenopiles
Embranchement Oomycota
Classe Oomycetes
Sous-classe Peronosporomycetidae
Ordre Peronosporales
Genre
Phytophthora
de Bary, 1876
Espèces de rang inférieur
Phytophthora botryosa

Phytophthora brassicae
Phytoohthora cactorum
Phytophthora cajani
Phytophthora cambivora
Phytophthora capsici
Phytophthora cinnamomi
Phytophthora citricola
Phytophthora citrophthora
Phytophthora clandestina
Phytophthora colocasiae
Phytophthora cryptogea
Phytophthora drechslera
Phytophthora erythroseptica
Phytophthora fragariae
Phytophthora gonapodyides
Phytophthora heveae
Phytophthora humicola
Phytophthora idaei
Phytophthora ilicis
Phytophthora infestans
Phytophthora inflata
Phytophthora iranica
Phytophthora katsurae
Phytophthora lateralis
Phytophthora medicagnis
Phytophthora megakarya
Phytophthora megasperma
Phytophthora melonis
Phytophthora mirabilis
Phytophthora multivesiculata
Phytophthora nicotianae
Phytophthora palmivora
Phytophthora phaseoli
Phytophthora porri
Phytophthora primulae
Phytophthora pseudotsugae
Phytophthora quercina
Phytophthora ramorum
Phytophthora sinensis
Phytophthora sojae
Phytophthora syringae
Phytophthora tentaculata
Phytophthora trifolii
Phytophthora vignae

Phytophthora (du Grec : φυτόν (phytón), “plante” and φθορά (phthorá), “destruction”) est un genre d'oomycète phytopathogène infectant un grand nombre de végétaux parmi lesquels se trouvent plusieurs plantes ou arbres cultivés tels la pomme de terre, la vigne, le châtaignier ou le pommier. Il touche également les cactus (mildiou des cactées). Le genre fût décrit pour la première fois en 1875 par Heinrich Anton de Bary. Approximativement 100 espèces de Phytophthora ont été décrites, cependant on estime leur nombre entre 100 et 500[1].


Sommaire

Biologie

Ces organismes autrefois classés parmi les champignons sont aujourd'hui rattachés aux straménopiles. En effet, bien que présentant un aspect morphologique semblable aux champignonsde part la présence de mycélium, leur biologie (métabolisme, cycle de reproduction sexuée) est très différente. La confusion taxonomique des oomycètes avec les champignons phytopathogènes a entraîné un retard dans l'acquisition de connaissances sur ce phytopathogène majeur.

Selon l'espèce considérée, une souche peut être pas, peu ou très pathogène et plus ou moins virulente selon les conditions de l'environnement et l'espèce hôte infectée. La gamme d'hôtes peut être étroite et limitée à quelques espèces (Phytophthora infestans) ou bien large et englobant plusieurs genres et familles de végétaux différents (Phytophthora ramorum, Phytophthora cinnamomi).

Les Phytophthora sont diploïdes à l'état végétatif et présentent des cycles de reproduction asexuée et sexuée. Le cycle de reproduction asexuée se réalise a l'aide de sporanges et de zoopsores ainsi que de chlamydospores pour certaines espèces. Le cycle de reproduction sexuée fait intervenir la production de gamétanges où se déroule la méiose (anthéridie et oogone) qui fusionneront pour former une oospore. Ils peuvent croître et se reproduire in vitro sans plante-hôte en milieux liquides ou gélosés, synthétiques ou à base d'extraits végétaux. Cependant, la présence de certains produits comme les stérols sont essentiels pour la fabrication des oospores.

Écologie

On sait que ces organismes peuvent être transportés par les canaux et cours d'eau [2]. En France, une espèce de Phytophthora, P. alni, est responsable des dépérissements massifs d'aulnes en bord de rivières de la fin des années 1990 aux années 2000.

On l'a cru cause première des dépérissements presque foudroyants de marronniers observés dans les années 2000, mais il pourrait n'être qu'un agent secondaire opportuniste, car non systématiquement trouvé. Le marronnier serait plutôt victime de la bactérie Pseudomonas syringae.

Espèces de Phytophthora

C'est un groupe d'espèces qui co-évolue probablement depuis très longtemps avec les plantes, en s'adaptant par de multiples stratégies à leurs systèmes de défense. Il est possible que les activités humaines (échanges et transports de produits agricoles, sylvicoles et horticoles) aient pu contribuer à propager certaines souches pathogènes dans le monde (mildiou de la vigne ou de la pomme de terre par exemple) ou à les favoriser en dégradant les sols et la diversité des végétaux cultivés. Des souches introduites peuvent attaquer des espèces indigènes. Par exemple, un colloque[3] a indiqué qu'en Australie en 2001 Phytophthora cinnamomi affectait directement 2000 des 9000 espèces indigènes du continent.
En 2010, on en connaissait 98 espèces[4], mais malgré les progrès de la systématique moléculaire, des confusions sont encore possibles dans la reconnaissance de nouvelles espèces et des difficultés persistent dans l'identification des espèces. Ceci est en partie dû au fait que certaines séquences de la GenBank sont encore mal identifiées (partir de cultures parfois mal annotées). Des Complexes d'espèces de P. capsici, P. citricola, P. cryptogea, P. dreschleri, P. megasperma pourront faire l'objet de révision taxonomie[4].

Certains sont considérés comme des pathogènes émergents, faisant l'objet de suivis dans certains pays  :

Traitement

Un traitement au Trichoderma harzianum peut être efficace dans certaines conditions[5].

Notes et références

  1. Brasier CM, 2009. Phytophthora biodiversity: how many Phytophthora species are there? In: Goheen EM, Frankel SJ, eds. Phytophthoras in Forests and Natural Ecosystems. Albany, CA, USA: USDA Forest Service: General Technical Report PSW-GTR-221, 101–15.
  2. Genotypes of Phytophthora ramorum in Waterways in Washington State Gary A Chastagner1, Katie Coats1, Daniel Omdal2, Amy Ramsey-Kroll2, and Marianne Elliott1 (Résumé )
  3. Second International Meeting on Phytophthora in Forests and Natural Ecosystems, Albany, Western Australia, Sept-Oct 2001.
  4. a et b Abstracts: 5th IUFRO Phytophthoras in Forests and Natural Ecosystems Auckland and Rotorua, New Zealand, 7-12 March 2010
  5. Biological control of Phytophthora cambivora (Petri) Buisman in chesnut tree

Lien externe


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Contenu soumis à la licence CC-BY-SA. Source : Article Phytophthora de Wikipédia en français (auteurs)

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