Dihydrolipoamide S-acétyltransférase

Acétyl-CoA:dihydrolipoamide S-acétyltransférase (E2) Structure d'une sous-unité de dihydrolipoamide S-acétyltransférase d’Azotobacter vinelandii consituant le noyau du complexe pyruvate déshydrogénase[1] ; PDB 1EAF.   N° EC   EC 2.3.1.12   N° CAS   9032-29-5   Bases de données   IntEnz   Vue IntEnz   BRENDA   Entrée BRENDA   IUBMB   2.3.1.12 à l'IUBMB   KEGG   Entrée KEGG   MetaCyc   Voie métabolique   PRIAM   Profil   PDB   Structures   GO   AmiGO / EGO

La dihydrolipoamide S-acétyltransférase (E2), ou dihydrolipoyl transacétylase, est la deuxième des trois enzymes du complexe pyruvate déshydrogénase (PDC), constitué d'une décarboxylase, d'une transacétylase et d'une réductase agissant séquentiellement dans la décarboxylation oxydative du pyruvate en acétyl-CoA, réaction qui réalise notamment la liaison entre la glycolyse et le cycle de Krebs ; les autres enzymes du complexe sont la pyruvate déshydrogénase (E1) et la dihydrolipoyl déshydrogénase (E3).

Le complexe pyruvate déshydrogénase

Article principal : complexe pyruvate déshydrogénase.

La réaction globale catalysée par le PDC est la suivante :

	+ CoA-SH + NAD+  →  NADH + H+ + CO2 +
Pyruvate		Acétyl-CoA

Le mécanisme de cette réaction est assez complexe, et peut être résumé par le schéma simplifié ci-dessous :

Mécanisme réactionnel du complexe pyruvate déshydrogénase (R = H sur ce schéma) :
    - la pyruvate déshydrogénase (E1) catalyse les étapes A et B avec la thiamine pyrophosphate (TPP),
    - la dihydrolipoamide S-acétyltransférase (E2) catalyse l'étape C avec la lipoamide et la coenzyme A (CoA-SH),
    - la dihydrolipoyl déshydrogénase (E3) catalyse les étapes D et E avec la FAD et la NAD⁺.

La dihydrolipoamide S-acétyltransférase

La dihydrolipoamide S-acétyltransférase est une acétyltransférase faisant intervenir successivement trois cofacteurs : la thiamine pyrophosphate (TPP, liée à la pyruvate déshydrogénase), la dihydrolipoamide et la coenzyme A (CoA-SH), cette dernière étant convertie en acétyl-coenzyme A (acétyl-CoA).

Thiamine pyrophosphate (TPP)		Dihydrolipoamide		Coenzyme A (CoA-SH)

Le véritable cofacteur est en fait l'acide lipoïque davantage que la (dihydro)lipoamide, mais cet acide carboxylique est lié par covalence à la protéine E2 au moyen d'une liaison amide sur un résidu lysine, ce qui donne l'équivalent d'un résidu lipoamide.

Acide lipoïque		L-Lysine

Nomenclature et dénominations

Le nom systématique de cette enzyme est acétyl-CoA:enzyme-N⁶-(dihydrolipoyl)lysine S-acétyltransférase.

Dans la littérature, elle peut cependant être désignée par tout une série de noms d'usage, tels que (liste non limitative) :

• acétyl-CoA:dihydrolipoamide S-acétyltransférase,
• acide lipoïque acétyltransférase,
• dihydrolipoamide S-acétyltransférase,
• dihydrolipoate acétyltransférase,
• dihydrolipoïque transacétylase,
• dihydrolipoyl acétyltransférase,
• lipoate acétyltransférase,
• lipoate transacétylase,
• lipoïque acétyltransférase,
• lipoic transacétylase,
• lipoylacétyltransférase,
• thioltransacétylase A,
• transacétylase X.

Notes et références

1. ↑ Mattevi A, Obmolova G, Kalk KH, Teplyakov A, Hol WG, « Crystallographic analysis of substrate binding and catalysis in dihydrolipoyl transacetylase (E2p) », dans Biochemistry, vol. 32, n^o 15, avril 1993, p. 3887–901 [lien PMID, lien DOI]