Abi prism collection

Abi prism collection est le logiciel chargé de faire la collecte des données brutes d'électrophorèse sur le séquenceur de gène Abi prism 310.

Le logiciel permet :

  • de faire son plan de plaque : noms des échantillons et position sur la plaque
  • de lancer l'électrophorèse

Le logiciel éffectue le pilotage de l'instrument afin de collecter les données brutes. La séquence des opérations est :

  • fermeture du canal du gel bloc du côté de la cuve de tampon,
  • coulage d'un nouveau polymère dans le capillaire entre chaque échantillon en agissant sur le piston relié à la seringue de polymère au niveau du gel block. Le vieux polymère est jeté dans le tube poubelle en position trois,
  • réouverture du canal du gel block,
  • positionnement dans le tube de la plaque correspondant à l'échantillon suivant,
  • électro-injection dans le tube,
  • rinçage de l'électrode et du capillaire,
  • lancement de l'électrophorèse,
  • collecte des données d'électrophorèse au bout d'un temps préprogrammé,
  • arrêt de la collecte au bout d'un autre temps préprogrammé (30 minutes généralement en gene scan ou 3 heures en séquence)
  • appel du programme d'analyse des données (gene-scan analysis ou sequencing analysis)
  • passage à l'échantillon suivant : le cycle recommence

Wikimedia Foundation. 2010.

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