Archaeplastida (Classification Phylogénétique)

Archaeplastida (classification phylogénétique)

Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Archaeplastida (ou Plantae, ou encore Archéplastides), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations évolutives complexes (relations groupes ancestraux - groupes descendants) existant entre les différents organismes vivants ou taxa, constituant ce groupe. Du fait de ses méthodes nouvelles basées sur la biologie moléculaire, la phylogénie, science récente à l'origine de la classification phylogénétique du vivant, est en plein essor et propose parfois des résultats en contradiction avec l'ancienne classification, majoritairement basée, elle, sur des critères morphologiques et physiologiques. Aussi, certains points particuliers font parfois encore l'objet de débats au sein de la communauté scientifique. L'objectif, s'il y a lieu, est également de présenter ces derniers ici.

Ce cladogramme présente aussi bien les groupes encore représentés aujourd'hui que ceux qui sont éteints (incluant les groupes fossiles).

À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien. De plus, pour plus de précisions si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.

Le symbole renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré.


Sommaire

Arbre phylogénétique


└─o Archaeplastida
  │
  ├─o Glaucophyta ou Glaucocystophyceae 
  │
  └─o Metabionta
    │
    ├─o Rhodophyta 
    │
    └─o Chloroplastida ou Chlorobionta ou Viridiplantae
      │
      ├─o Chlorophyta s.s. 
      │
      └─o Streptophyta ou Charophyta s.l.
        │
        ├─o Zygnematophyceae 
        │
        └─o Plasmodesmophyta ou Streptophytina
          ├─o Charophyceae
          └─o Embryophyta
            │
            ├─o Marchantiophyta ou Hepaticophyta 
            │
            └─o Stomatophyta
              │
              ├─o Bryophyta 
              │
              └─o Tracheophyta ou Tracheobionta
                │
                ├─o Lycophyta ou Lycopodiophyta 
                └─o
                  ├─o Monilophyta
                  │ │
                  │ ├─o Filicophyta ou Polypodiidae 
                  │ │
                  │ └─o Equisetophyta ou Sphenophyta 
                  │
                  └─o Spermatophyta
                    ├─o
                    │ ├─o Cycadophyta 
                    │ └─o
                    │   ├─o Pinophyta ou Coniferophyta 
                    │   │
                    │   └─o Ginkgoales
                    │
                    └─o Magnoliophyta ou Angiospermae 

Débat scientifique relatif à la phylogénie des Archaeplastida

Dans l'arbre ci-dessus, les principales questions qui font débat sont :

  • la monophylie des Archéplastides elles-mêmes, question liée à celle des endosymbioses parmi les « végétaux » : la notion d'archéplastide, comme le nom l'indique, suppose une endosymbiose primaire à la base de tout le groupe, la présence de chloroplastes dans la « lignée brune » (Straménopiles) et autres « algues » protistes s'expliquant par des endosymbioses secondaires plus récentes dans les lignées considérées – ce qui est aujourd'hui contesté ;
  • liée à cette question, celle de la place des Rhodophytes : groupe-frère des Viridiplantae ou de tous les Bicontes dont les cellules comportent des chloroplastes ?
  • la place des Zygnématophytes par rapport aux Charales : quel est le groupe-frère des Embryophytes ?
  • la monophylie et la place des Coléochétophycées et leur relation aux Charophycées s.s. ;
  • la place des Anthocérotes par rapport aux Bryophytes : quel est le groupe-frère des Polysporangiophytes ?
  • la place des Marattiales au sein des Monilophytes ; groupe-frère des Équisétophytes ou des Filicophytes ?
  • la monophylie des Gymnospermes actuelles, et la parenté des Angiospermes avec les taxons éteints.

Concernant les Embryophytes, l'arbre présenté ici suit assez fidèlement la synthèse des derniers travaux, présentée par l' Angiosperm Phylogeny Website.

Classification selon Cavalier-Smith 1998

Cette classification n'est pas à proprement parler phylogénétique. Basée sur les nouvelles phylogénies, elle maintient néanmoins des taxons paraphylétiques, notamment à la base des lignées évolutives, par commodité. Elle maintient également les niveaux traditionnels de classification (règnes, phyla, classes, etc.).

Arbre phylogénétique simplifié selon Nozaki et al. 2003

L'analyse portait essentiellement sur les organismes à plastes, les Discicristés, Straménopiles et Alvéolés se retrouvant à l'intérieur d'un vaste clade rendant les Archaeplastida paraphylétiques. Les Rhodophytes seraient la lignée la plus proche de la base des Bicontes (sous réserve de la place indéterminée des organismes sans mitochondrie). La place des Rhizariens n'est pas évoquée.

Classification proposée par Adl et al. 2005

Ce comité a proposé une nouvelle classification, remplaçant celle des anciens Protistes et tenant compte des phylogénies moléculaires récentes. Elle regroupe les Eucaryotes en six groupes réputés monophylétiques. Voici ce qui concerne les Archaeplastida.

En savoir plus

Sources bibliographiques de référence

Autres sources bibliographiques

Sources internet

Liens internes


Grimmia pulvinata (Bryophyta, Grimmiaceae)
Encephalartos woodii (Cycadophyta, Zamiaceae)
Dicksonia antarctica (Filicophyta, Dicksoniaceae)
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